Missão, Visão e Valores são um conjunto de elementos que dão propósito e identidade para uma organização, além de orientar suas ações.
Nesse sentido, a grande Missão do Instituto Guaicuy é executar ações que promovam uma abordagem ecossistêmica sobre a relação entre as pessoas e seus territórios, empoderando comunidades e reconhecendo as Bacias Hidrográficas como centralidade do que realizamos.
Para que essa Missão seja bem executada, a Visão que direciona o caminho do Guaicuy é a de ser uma organização referência no debate nacional sobre saúde ambiental e na construção de uma sociedade mais justa, saudável, solidária e participativa, valorando e valorizando os diversos aspectos da vida na Terra.
Por fim, como âncora de todas as ações executadas, o Instituto Guaicuy preza pelos Valores do acolhimento, respeito às diversidades, trocas de saberes e reconhecimento, colaboração, solidariedade, formação e empoderamento.